DYA Gipuzkoako Zuzendaritza erabat asanblearioa den sistema batean oinarritzen da, zeinetan erabakitzeko organo gorena Bazkideen Batzar Orokorra den:
Batzarrak erakundearen gestioaren ildo estrategikoak zehazten ditu, baita bere baliabideen erabilera ere. Eguneroko gestioaz Zuzendaritza Batzorde Probintziala eta zuzendaritza ekipoa (Zuzendaritza Batzordea) arduratzen dira, ze egunerokotasunean bazkideek hartutako erabakiak gauzatzeaz arduratzen dira.
Gaur egun DYA Gipuzkoako Zuzendaritza Batzordea osatzen duten pertsonak ondorengoak dira:
- Presidentea: Irene Tapia Irazoki And.
- Presidenteordea: Oliva Caballero Moreno And.
- Idazkari Probintziala: Igotz Zabaleta Oliden Jn.
- Diruzain Probintziala: Javier Barace Imizcoz Jn.
- Boluntariotzaren Arretarako Saileko arduraduna: Meritxell Galarraga Fernández.
- Gizarte Zerbitzu Saileko arduraduna: Milena Johanna Lagos Romero eta Oliva Caballero Moreno And.
- Osasun eta Irakaskuntza Saileko arduraduna: Igotz Zabaleta Oliden Jn.
- Erreskate eta Herritarrentzako Laguntza Saileko arduraduna:
Eukeni Portu Gutiérrez Jn., Jon Urien Crespo Jn. eta José Mª Paternain Górriz Jn. - Transmisio arduraduna: Álvaro Vega Antoñana Jn.
- Mekanika Saileko arduraduna: Patxi Lersundi Ayestaran Jn.